Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Six6Q9QZ28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Six6Q9QZ28 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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