Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pcsk1nQ9QXV0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pcsk1nQ9QXV0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms