Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Limd1Q9QXD8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Limd1Q9QXD8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms