Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Higd1aQ9JLR9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms