Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL99

Clec1b, C-type lectin domain family 1 member B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec1bQ9JL99 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec1bQ9JL99 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Clec1bQ9JL99 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Clec1bQ9JL99 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Clec1bQ9JL99 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Clec1bQ9JL99 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Clec1bQ9JL99 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clec1bQ9JL99 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms