Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FancaQ9JL70 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FancaQ9JL70 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms