Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Gde1Q9JL56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gde1Q9JL56 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Gde1Q9JL56 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gde1Q9JL56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms