Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY5

Hip1r, Huntingtin-interacting protein 1-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hip1rQ9JKY5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hip1rQ9JKY5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hip1rQ9JKY5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms