Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scamp4Q9JKV5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scamp4Q9JKV5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms