Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrac1Q9JKP8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms