Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms