Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Uchl3Q9JKB1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Uchl3Q9JKB1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms