Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Pard6bQ9JK83 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pard6bQ9JK83 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms