Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cnga3Q9JJZ8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnga3Q9JJZ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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