Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gfra4Q9JJT2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms