Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spag4Q9JJF2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spag4Q9JJF2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms