Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sv2aQ9JIS5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms