Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ercc6l2Q9JIM3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms