Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn12Q9ET43 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Cldn12Q9ET43 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cldn12Q9ET43 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn12Q9ET43 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn12Q9ET43 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms