Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capn12Q9ER56 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Capn12Q9ER56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms