Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Col4a3bpQ9EQG9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col4a3bpQ9EQG9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms