Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csnk1dQ9DC28 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Csnk1dQ9DC28 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk1dQ9DC28 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Csnk1dQ9DC28 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms