Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Syde1Q9DBZ9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms