Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smg9Q9DB90 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms