Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smim23Q9DAL0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smim23Q9DAL0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms