Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhobtb1Q9DAK3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rhobtb1Q9DAK3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms