Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700109H08RikQ9D9C0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700109H08RikQ9D9C0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700109H08RikQ9D9C0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700109H08RikQ9D9C0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
1700109H08RikQ9D9C0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms