Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mrpl17Q9D8P4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mrpl17Q9D8P4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms