Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Lin37Q9D8N6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lin37Q9D8N6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Lin37Q9D8N6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Lin37Q9D8N6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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