Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl4Q9D8E6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl4Q9D8E6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms