Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ttc9bQ9D6E4 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms