Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rab11fip1Q9D620 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Rab11fip1Q9D620 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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