Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D5Q8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms