Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc7Q9D541 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc7Q9D541 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms