Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam227bQ9D518 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms