Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lrp2bpQ9D4C6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lrp2bpQ9D4C6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms