Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
4933428M09RikQ9D3X3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms