Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Lrrc71Q9D3W5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc71Q9D3W5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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