Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snx29Q9D3S3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx29Q9D3S3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms