Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rufy3Q9D394 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rufy3Q9D394 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms