Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim42Q9D2H5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim42Q9D2H5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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