Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pramef12Q9D2F1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Pramef12Q9D2F1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms