Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Chordc1Q9D1P4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Chordc1Q9D1P4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms