Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SarnpQ9D1J3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms