Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hddc3Q9D114 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hddc3Q9D114 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms