Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpsap1Q9D0M1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpsap1Q9D0M1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms