Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FopnlQ9CZS3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms