Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prdm5Q9CXE0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms