Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Yif1bQ9CX30 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Yif1bQ9CX30 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms