Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ddx28Q9CWT6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ddx28Q9CWT6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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